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dovetailgenomics 21007說明書

更新時間:2021-09-08      點擊次數(shù):2896

 

Dovetail Genomics 是一家位于圣克魯斯的初創(chuàng)生命科學公司,致力于開發(fā)基因組學技術,以改善基因組組裝、揭示關鍵的結(jié)構變異信息以及基因組學中的許多其他令人興奮的應用。

dovetailgenomics 21007說明書

Dovetail™ HiChIP MNase Kit

 

Catalogue #: 21007

規(guī)格

反應

8

驗證樣本

哺乳動物細胞

技術

Hi-C, ChIP-seq

標簽

僅供研究使用

應用程序

蛋白質(zhì)定向染色質(zhì)構象、基因調(diào)控和新型增強子和超級增強子的發(fā)現(xiàn)

Dovetail™ HiChIP MNase Kit 結(jié)合了 ChIP-seq 和 Hi-C 的優(yōu)點,Hi-C 是一種鄰近連接方法,使用標準的 Illumina 雙端測序捕獲長距離相互作用,使研究人員能夠查詢由特定蛋白質(zhì)介導的蛋白質(zhì)定向染色質(zhì)構象。興趣。
除抗體外,該試劑盒提供了在生成 NGS 文庫之前對哺乳動物樣本進行染色質(zhì)免疫沉淀和鄰近連接步驟所需的所有試劑。該試劑盒與用于 Illumina 的 Dovetail™ 文庫模塊(貨號 #25004)和用于 Illumina 測序的第 3 方標準雙端文庫制備試劑盒兼容。

 

 

Dovetail HiChIP Kit 具有以下主要優(yōu)勢:

  • 在單個庫中同時捕獲 ChIP-seq 和 Hi-C 數(shù)據(jù)

  • 推出更多即用型抗體

  • 以核小體水平分辨率繪制染色質(zhì)相互作用圖

從樣品到測序就緒文庫的簡單三天工作流程

與其他類似方法相比,Dovetail HiChIP 工作流程具有多項優(yōu)勢:

  • 染色質(zhì)的酶促和均勻裂解

  • 來自鄰近結(jié)扎的遠程信息的豐富

  • 穩(wěn)健性和重現(xiàn)性低至一百萬個細胞輸入

  • 經(jīng)驗證的常見抗體清單

Dovetail™ Micro-C Proximity Ligation Assay 與 Dovetail HiChIP 方法的*組合使使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 能夠在鄰近連接之前均勻地分割染色質(zhì),沒有序列偏差,消除了對精細超聲處理程序的需要,并提供了染色質(zhì)相互作用的最大分辨率(低至單核小體大小)。

繪制蛋白質(zhì)結(jié)合位點和長程蛋白質(zhì)定向相互作用

Dovetail HiChIP Kit 能夠研究蛋白質(zhì)導向的 3-D 染色質(zhì)相互作用。與 ChIP-seq 類似,Dovetail HiChIP 數(shù)據(jù)捕獲由目標蛋白質(zhì)直接結(jié)合的序列。然而,還捕獲了由感興趣的蛋白質(zhì)介導的其他遠程相互作用。在測定中使用MNase 會產(chǎn)生核小體分辨率數(shù)據(jù)。

以較少的順序生成高分辨率的接觸圖

蛋白質(zhì)導向染色質(zhì)特征的富集使高分辨率接觸圖生成成為可能,但讀取深度更小。與基于高分辨率限制性內(nèi)切酶的 Hi-C 相比,Dovetail HiChIP 數(shù)據(jù)能夠以讀取深度的一小部分顯示高階染色質(zhì)特征,例如環(huán)和染色質(zhì)相互作用,從而顯著節(jié)省測序成本。

 

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